Факультет естественных наук нацелен, главным образом на подготовку исследователей, которые будут работать в науке. Система обучения на Факультете строится таким образом, что студенты биологического отделения изучают большой блок химических дисциплин, таких как физическая, неорганическая и органическая химия. В свою очередь, студенты-химики изучают такие предметы, как экология, охрана окружающей среды, химические основы жизни, ферментативный катализ и химия метаболизма, молекулярная биология. Такой подход к химико-биологическому образованию совершенно необходим для подготовки высококвалифицированных исследователей современной формации.
Биологическое отделение ведет подготовку бакалавров и магистров биологии, а также аспирантов по направлению «Биологические науки» и представлено пятью кафедрами (все кафедры являются выпускающими – на них происходит специализация), для которых базовыми являются профильные исследовательские институты СО РАН. Помимо этого, студенты-биологи проходят дипломную практику и в институтах СО РАМН, а также в Государственном научном центре вирусологии и биотехнологии "Вектор" в наукограде Кольцово, Институте систематики и экологии животных, а также в Центральном сибирскм ботаническом саду СО РАН.
